مرآة البحرين: وافق مجلس الوزراء في جلسته الأخيرة 28 سبتمبر 2020، على إعادة تنظيم وزارة الداخلية بحيث يصبح المركز الوطني للأمن السيبراني من ضمن الهيكل التنظيمي لوزارة الداخلية ويتبع وزير الداخلية، ويتكون الهيكل التنظيمي للمركز من رئيس تنفيذي بدرجة وكيل وزارة ويتبعه نائب الرئيس للعمليات السيبرانية بدرجة وكيل مساعد وعدد من الإدارات ، وذلك في ضوء المذكرة المرفوعة لهذا الغرض من وزير الداخلية.
وكان المركز سابقا ملحق بإدارة مكافحة بالإدارة العامة لمكافحة الفساد والأمن الاقتصادي والإلكتروني.